Polimorfismos de los genes P53, CYP1A1, CYP1B1, GSTM1, GSTT1 y GSTP1 en cáncer de seno familiar en una población colombiana

Se considera que la susceptibilidad al cáncer de seno es poligenética1; es necesario estudiar otros factores genéticos. Se realizó un estudio analítico de casos y controles (1:2) 120:240. Se tomó una muestra de sangre periférica, y posteriormente se realizó la extracción de ADN (PROBE) y se determinó la presencia de los polimorfismos. Se encontraron asociaciones estadísticamente significativas con el cáncer de seno para: del grupo p53 exón 4, la Arginina con un OR 1,923 IC 95% (1,117 – 3.309); del grupo p53 intrón 3 el I3wm con OR 30,887 IC 95% (3,709 – 257,209); del grupo p53 intrón 6 el I6wm con OR 2.061 IC 95% (1.059 - 4,013); del grupo CYP1B1 Val432leu, la Valina con un OR 2.273 con un IC del 95% (1.084 – 4.855); del grupo CYP1B1 Asn453se la Asparagina/Serina con un OR 1,987 con IC 95% (1.076 – 3.670). El polimorfismo gstm 1r reporta un OR 0,366 con IC 95% (0,219 – 0,613) el cual se considera como protector para cáncer de seno.

Study of tumor suppressor genes p53 and Rb in acute myelogenous leukemia

Loss of antiproliferative function of p53 by point mutation occurred frequently in various solid tumors. However, the genetic change of p53 by deletion or point mutation was a rare event (6%) in the cells of 49 AML patients analyzed by single-stranded conformation polymorphism and sequencing. Despite infrequent point mutation, abundant levels of p53 protein were detected in 75% of AML patients studied by immunoprecipitation with p53 specific antibodies. Furthermore, p53 protein in most cases had an altered conformation as analyzed by the reactivity to PAb240 which recognizes mutant p53; p53 protein in mitogen stimulated normal lymphocytes also had similar altered conformation. This altered conformation may be another mechanism for inactivation of p53 function in the growth stimulated environment. Some evidence indicated that posttranslational modification by phosphorylation may contribute to the conformational change of p53.^ Retinoblastoma (Rb) gene inactivation by deletion, rearrangement or mutation has also been implicated in many types of solid tumors. Our studies showed that absence or low levels of Rb protein were observed in more than 20% of AML patients at diagnosis, and the low levels of Rb correlated with shorter survival of patients. The absence of Rb protein was due to gene inactivation in some cases and to abnormal regulation of Rb expression in others. ^

PCR bias Toward the wild-type k-ras and p53 sequences: Implications for PCR detection of mutations and cancer diagnosis

PCR-based cancer diagnosis requires detection of rare mutations in k- ras, p53 or other genes. The assumption has been that mutant and wild-type sequences amplify with near equal efficiency, so that they are eventually present in proportions representative of the starting material. Work on factor IX suggests that this assumption is invalid for one case of near- sequence identity. To test the generality of this phenomenon and its relevance to cancer diagnosis, primers distant from point mutations in p53 and k-ras were used to amplify wild-type and mutant sequences from these genes. A substantial bias against PCR amplification of mutants was observed for two regions of the p53 gene and one region of k-ras. For k-ras and p53, bias was observed when the wild-type and mutant sequences were amplified separately or when mixed in equal proportions before PCR. Bias was present with proofreading and non-proofreading polymerase. Mutant and wild-type segments of the factor V, cystic fibrosis transmembrane conductance regulator and prothrombin genes were amplified and did not exhibit PCR bias. Therefore, the assumption of equal PCR efficiency for point mutant and wild-type sequences is invalid in several systems. Quantitative or diagnostic PCR will require validation for each locus, and enrichment strategies may be needed to optimize detection of mutants.

Association of CYP1B1 codon 432 mutant allele in head and neck squamous cell cancer is reflected by somatic mutations of p53 in tumor tissue

Tobacco use is causally associated with head and neck squamous cell cancer (HNSCC). Here, we present the results of a case-control study that investigated the effects that the genetic variants of the cytochrome (CYP)1A1, CYP1B1, glutathione-S-transferase (GST)M1, GSTT1, and GSTP1 genes have on modifying the risk of smoking-related HNSCC. Allelisms of the CYP1A1, GSTT1, GSTM1, and GSTT1 genes alone were not associated with an increased risk. CYP1B1 codon 432 polymorphism was found to be a putative susceptibility factor in smoking-related HNSCC. The frequency of CYP1B1 polymorphism was significantly higher (P < 0.001) in the group of smoking cases when compared with smoking controls. Additionally, an odds ratio (OR) of 4.53 (2.62-7.98) was discovered when investigating smoking and nonsmoking cases for the susceptible genotype CYP1B1*2/*2, when compared with the presence of the genotype wild type. In combination with polymorphic variants of the GST genes, a synergistic-effect OR was observed. The calculated OR for the combined genotype CYP1B1*2/*2 and GSTM1*2/*2 was 12.8 (4.09-49.7). The calculated OR for the combined genotype was 13.4 (2.92-97.7) for CYP1B1*2/*2 and GSTT1*2/*2, and 24.1 (9.36-70.5) for the combination of CYP1B1*2/*2 and GSTT1-expressors. The impact of the polymorphic variants of the CYP1B1 gene on HNSCC risk is reflected by the strong association with the frequency of somatic mutations of the p53 gene. Smokers with susceptible genotype CYP1B1*2/*2 were 20 times more likely to show evidence of p53 mutations than were those with CYP1B1 wild type. Combined genotype analysis of CYP1B1 and GSTM1 or GSTT1 revealed interactive effects on the occurrence of p53 gene mutations. The results of the present study indicate that polymorphic variants of CYP1B1 relate significantly to the individual susceptibility of smokers to HNSCC.

Adaptação digestiva com duodenal switch parcial em pacientes diabéticos e com IMC<35 Kg/m2. Análise da resposta clínica, laboratorial, enterohormonal e da expressão do gene p53 na mucosa intestinal

O diabetes mellitus tipo 2 (DM2) é uma doença de prevalência crescente na população mundial, sendo associado ao aumento de diversas comorbidades. A relação entre o trato digestivo e o DM2 tem sido fortalecida a partir dos resultados das diferentes cirurgias metabólicas frente à remissão do distúrbio endócrino. Alterações morfológicas hipertróficas no epitélio intestinal são percebidas nos estágios iniciais da doença e parece ter papel primordial na instalação da hiperglicemia crônica. O gene p53 participa ativamente dos processos de regulação do crescimento epitelial intestinal e pode sofrer alteração de sua expressão em estados diabéticos. Objetiva-se avaliar os resultados clínicos e laboratoriais de pacientes DM2 e com índice de Massa Corpórea (IMC) >25 e <35 Kg/m2 submetidos a cirurgia metabólica denominada adaptação digestiva com duodenal switch parcial (DSP) e avaliar o comportamento da expressão do gene p53 na mucosa intestinal no período pré e pós-operatório. Nove pacientes DM2, com IMC<35Kg/m2 foram operados pela técnica DSP. Biópsias de duodeno e íleo foram colhidas no estado diabético (pré e transoperatório respectivamente) e, 3 meses após a cirurgia, através de endoscopia digestiva alta. Foram comparados os dados de evolução antropométrica (IMC) e laboratorial no período pré e pós-operatório. Através do método enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) foram determinados os níveis dos entero-hormônios glucagon-like peptide-1 (GLP-1) e glucose-dependent insulinotropic peptide (GIP), no pré e pós-operatório, em jejum e pós-prandial nos períodos 30',60',90' e 120'. A expressão do gene p53, foi avaliada por real time polymerase chain reaction (qrt-PCR) e western blot, nos dois diferentes momentos. As variáveis: glicemia de jejum e pós-prandial (2 horas), trigliceridemia de jejum, hemoglobina glicada (HbAc1) e peptídeo C foram analisadas. As médias dos parâmetros laboratoriais foram comparadas pela análise multivariada ANOVA e após teste-Tukey. A média de expressão relativa do gene p53 foi comparada nos dois períodos pelo teste t-student. Os resultados evidenciaram que entre maio e dezembro de 2010, nove pacientes (4 homens, 5 mulheres) DM2 e com IMC entre 26 e 34Kg/m2 foram submetidos a DSP. A média de IMC do grupo operado foi de 31,3. Houve queda do IMC média de 23% após um ano. Houve queda significativa (p<0,05) nos níveis de triglicerídeos, glicemia de jejum e pós-prandial (2 horas), HbA1c assim como aumento do peptídeo-C (p<0,05), quando comparados os períodos pré e pós-operatório. Os níveis séricos de GLP-1 foram significativamente maiores no pós-operatório (p<0,05), tanto em jejum como pós-prandial sendo que houve diminuição dos níveis de GIP, contudo sem significância estatística. O gene p53 sofreu aumento significativo de sua expressão relativa (qrt-PCR)(p<0,05) no período pós-operatório na mucosa duodenal e uma tendência de aumento no íleo, contudo sem significância estatística. A análise da expressão ao nível proteico foi bem sucedida somente no íleo, também mostrando tendência de aumento. Concluí-se que a DSP foi capaz de controlar satisfatoriamente o DM2 em pacientes com IMC<35 Kg/m2. Houve aumento da secreção de GLP-1 e tendência de diminuição do GIP. Houve aumento da expressão do p53 na mucosa intestinal, no período pós-operatório, após o controle do diabetes, quando comparada ao período pré-operatório.

The Role of Thymidylate Synthase Induction in Modulating p53-regulated Gene Expression in Response to 5-Fluorouracil and Antifolates

Thymidylate synthase (TS) is a critical target for chemotherapeutic agents such as 5-fluorouracil (5-FU) and antifolates such as tomudex (TDX),multitargeted antifolate, and ZD9331. Using the MCF-7 breast cancer line, we have developed p53 wild-type (M7TS90) and null (M7TS90-E6) isogenic lines with inducible TS expression (approximately 6-fold induction compared with control after 48 h). In the M7TS90 line, inducible TS expression resulted in a moderate approximately 3-fold increase in 5-FU IC-50(72 h) dose and a dramatic >20-fold increase in the IC-50(72 h) doses of TDX, multitargeted antifolate, and ZD9331. S-phase cell cycle arrest and apoptosis induced by the antifolates were abrogated by TS induction. In contrast, cell cycle arrest and apoptosis induced by 5-FU was unaffected by TS expression levels. Inactivation of p53 significantly increased resistance to 5-FU and the antifolates with IC-50(72 h) doses for 5-FU and TDX of >100 and >10 microM, respectively, in the M7TS90-E6 cell line. Furthermore, p53 inactivation completely abrogated the cell cycle arrest and apoptosis induced by 5-FU. The antifolates induced S-phase arrest in the p53 null cell line; however, the induction of apoptosis by these agents was significantly reduced compared with p53 wild-type cells. Both inducible TS expression and the addition of exogenous thymidine (10 microM) blocked p53 and p21 induction by the antifolates but not by 5-FU in the M7TS90 cell line. Similarly, inducible TS expression and exogenous thymidine abrogated antifolate but not 5-FU-mediated up-regulation of Fas/CD95 in M7TS90 cells. Our results indicate that in M7TS90 cells, inducible TS expression modulates p53 and p53 target gene expression in response to TS-targeted antifolate therapies but not to 5-FU.

The prognostic significance of the aberrant extremes of p53 immunophenotypes in breast cancer

Aims: The utility of p53 as a prognostic assay has been elusive. The aims of this study were to describe a novel, reproducible scoring system and assess the relationship between differential p53 immunohistochemistry (IHC) expression patterns, TP53 mutation status and patient outcomes in breast cancer.

Methods and Results: Tissue microarrays were used to study p53 IHC expression patterns: expression was defined as extreme positive (EP), extreme negative (EN), and non-extreme (NE; intermediate patterns). Overall survival (OS) was used to define patient outcome. A representative subgroup (n = 30) showing the various p53 immunophenotypes was analysed for TP53 hotspot mutation status (exons 4-9). Extreme expression of any type occurred in 176 of 288 (61%) cases. As compared with NE expression, EP expression was significantly associated (P = 0.039) with poorer OS. In addition, as compared with NE expression, EN expression was associated (P = 0.059) with poorer OS. Combining cases showing either EP or EN expression better predicted OS than either pattern alone (P = 0.028). This combination immunophenotype was significant in univariate but not multivariate analysis. In subgroup analysis, six substitution exon mutations were detected, all corresponding to extreme IHC phenotypes. Five missense mutations corresponded to EP staining, and the nonsense mutation corresponded to EN staining. No mutations were detected in the NE group.

Conclusions: Patients with extreme p53 IHC expression have a worse OS than those with NE expression. Accounting for EN as well as EP expression improves the prognostic impact. Extreme expression positively correlates with nodal stage and histological grade, and negatively with hormone receptor status. Extreme expression may relate to specific mutational status.

Measuring a cell's response to stress:the p53 pathway.

Relação entre os critérios diagnósticos histológicos e a expressão imuno-histoquímica da P53 no carcinoma prostático

Introdução e Objetivo: o gene TP53 é o alvo isoladamente mais comum de mutação em tumores humanos. Está envolvido no bloqueio do ciclo celular, reparo ao DNA, diferenciação celular e apoptose, em resposta ao dano genético. O exame de imuno-histoquímica (IHQ) pode detectar o acúmulo da proteína p53 no núcleo celular, indicando mutação. Esta mutação tem sido associada a comportamento agressivo nos carcinomas prostáticos. O conhecimento das características histológicas deste carcinoma permite o estabelecimento de critérios diagnósticos anatomopatológicos e de graduações histológicas que visam a um melhor atendimento dos pacientes com a doença. O estudo da relação entre os achados de biologia molecular e as características histológicas desta neoplasia leva a um maior conhecimento de mecanismos que produzem as alterações morfológicas teciduais, auxiliando na identificação de novas variáveis promissoras na determinação do comportamento biológico da doença. Material e Método: foram examinadas amostras de 101 exames de biópsias por agulha da próstata, de setenta pacientes com carcinoma, através de lâminas coradas pelo HE, selecionados de 500 exames consecutivos. Obtiveram-se novos cortes dos mesmos blocos de parafina, sendo estes corados pela técnica de IHQ, utilizando o anticorpo monoclonal DO7 para p53, em 69 dos pacientes. Foram anotados, para estudo de associação, os achados morfológicos de carcinoma, o padrão da coloração IHQ para p53, a presença de invasão de nervos (IN) pelas colorações HE e de IHQ para proteína S100 e algumas características clínico-laboratoriais dos pacientes com carcinoma prostático. Resultados: dentre as formas de aferir a positividade IHQ da p53, a imunorreatividade em grupamento foi o padrão que melhor se correlacionou com os achados clínico-patológicos examinados: PSA sérico, escore de Gleason, quantidade de tumor na amostra (p<0,01) e presença de invasão de nervo. Dentre os critérios diagnósticos estudados, houve associação estatisticamente significativa da imunorreatividade em grupamento para p53 com as presenças de micronódulos de colágeno e mais de um nucléolo proeminente no mesmo núcleo de célula neoplásica. Quanto à IN, apenas quando a mesma foi identificada com a técnica de IHQ (proteína S100), houve associação estatisticamente significativa. Conclusão: o padrão de imunorreatividade em grupamento mostra-se superior aos demais quando comparado aos achados anatomopatológicos com valor preditivo em biópsias e com o valor do PSA sérico. A associação estatisticamente significativa entre a imunorreatividade em grupamento para p53 e a presença de IN detectada com a utilização da proteína S100 contrasta com a ausência de significância quando a IN é identificada na histologia convencional (HE). Estes achados recomendam novos estudos para verificar a utilidade da determinação IHQ da IN no prognóstico da doença e para identificar o mecanismo molecular de invasão de nervos de pequeno tamanho que não são facilmente identificados no HE. A presença da associação da positividade IHQ para p53 com micronódulos de colágeno igualmente recomenda novos estudos clínicos e moleculares para esclarecimento da relação deste achado histológico com o comportamento biológico do carcinoma prostático.

Expressão de p53 e relação clínico-patológica no adenocarcinoma de reto

O adenocarcinoma colorretal é um dos tumores malignos mais freqüentes no mundo ocidental. Sua incidência varia mundialmente; nos Estados Unidos (EUA), é o terceiro câncer mais comum entre os homens e o segundo mais comum entre as mulheres, sendo a segunda causa de morte por câncer, superada apenas pelo tumor de pulmão. No Brasil, está entre as seis neoplasias mais freqüentes, ocupando a quarta posição em mortalidade. Os principais indicadores prognósticos do adenocarcinoma colorretal incluem a diferenciação histológica, profundidade de invasão e ocorrência de metástases. Recentemente, têm sido realizados diversos estudos usando técnicas de biologia molecular objetivando a identificação de novos parâmetros prognósticos. Entre estes, os fatores que regulam o ciclo celular influenciando no crescimento e mecanismo de apoptose têm demonstrado resultados promissores. O p53 é um gene supressor de tumores, localizado no braço curto do cromossomo 17; produz uma proteína chamada p53. Sua principal função é controlar pontos de checagem do ciclo celular, promover o reparo do DNA através do estímulo de outras proteínas (p21, por exemplo) e estimular a apoptose. Mutações deste gene produzem uma proteína p53 inativa que acumula nas células tumorais. A expressão desta proteína alterada é detectada em 30 a 70% dos tumores de reto e pode estar relacionada a mau prognóstico. O p53 é um dos genes mais comumente mutados no câncer humano. O objetivo deste estudo foi correlacionar a expressão imuno-histoquímica da proteína p53 com variáveis clínico-patológicas do adenocarcinoma de reto e sobrevida. Foram estudados 83 casos de pacientes operados no Hospital de Clínicas de Porto Alegre entre 1985 e 1997 através de reação imunohistoquímica utilizando anticorpo monoclonal Pab-1801 em amostras biológicas fixadas em formalina e armazenadas em blocos de parafina. Com um ponto de corte de 5%, 44 pacientes (53%) demonstraram expressão imunohistoquímica da proteína p53 maior que 5% e, com um ponto de corte de 20%, 36 pacientes (43,4%) demonstraram a expressão maior que 20%. Não houve associação estatisticamente significativa entre a expressão de p53 e as variáveis idade, gênero, localização, tamanho do tumor e comprometimento circunferencial. Encontramos associação entre p53 e óbito, recidiva local, metástases e recidiva total quando utilizado o ponto de corte de 20%, indicando um pior prognóstico nos pacientes com p53 positivos. Na análise multivariada em relação à sobrevida, o p53 teve poder prognóstico independente em relação às variáveis da classificação Astler- Coller e grau de diferenciação histológica da neoplasia.

Análise molecular do gene p53 em pacientes com esofagite, metaplasia intestinal da cárdia e esôfago de Barrett

Resumo não disponível.

Expressão da p53 no tumor e no epitélio oral em pacientes com câncer de boca e faringe

INTRODUÇÃO: Expressiva porcentagem de pacientes com carcinomas de boca e faringe apresentam superexpressão da proteína p53 induzida por tabaco, álcool e radioterapia. OBJETIVO: Descrever a expressão da p53 em áreas de mucosa normal adjacente ao tumor e em carcinomas da boca e faringe. MÉTODO: Estudo prospectivo, com seguimento clínico por um ano, de 24 pacientes com câncer espinocelular de boca e faringe. Foram feitas biópsias na neoplasia e em áreas de mucosa normal adjacente ao tumor, antes e 9 meses após a radioterapia, e realizado estudo imunohistoquímico da expressão da p53. RESULTADOS: Antes da radioterapia, houve alteração da expressão da p53 em 20 das 24 biópsias feitas na neoplasia e em 14 nas de mucosa normal adjacente ao tumor. Onze paciente morreram antes de 1 ano de seguimento clínico. Dos 2 pacientes iniciais com aumento da p53 após a radioterapia continuava aumentada em 7 na área da neoplasia e em 6 nas áreas de mucosa normal. Observou-se associação da p53 com o tabagismo e estádio do tumor (p < 5%) mas não com o grau de diferenciação celular e alcoolismo. CONCLUSÃO: O aumento da expressão da p53 foi observado tanto na área da neoplasia como em mucosa normal na maioria dos pacientes com carcinoma de boca e faringe antes e após a radioterapia. Houve correlação estatisticamente significante da expressão da p53 com o tabagismo e estádio da neoplasia.

Gastric adenocarcinoma and Helicobacter pylori: Correlation with p53 mutation and p27 immunoexpression

Introduction: Helicobacter pylori infection is an established risk factor for gastric cancer development, but the exact underlying mechanism still remains obscure. The inactivation of tumor suppressor genes such as p53 and p27(KIP1) is a hypothesized mechanism, although there is no consensus regarding the influence of H. pylori cagA(+) in the development of these genetic alterations. Goals: To verify the relationship among H. pylori infection, p53 mutations and p27(Kip1) Protein (p27) expression in gastric adenocarcinomas (GA) seventy-four tissues were assayed by PCR for H. pylori and cagA presence. Mutational analysis of p53 gene was performed by single-strand conformation polymorphism (SSCP). Seventy tissues were analyzed by an immunohistochemical method for p27 expression. Results: From the samples examined, 95% (70/74) were H. pylori positive, 63% cagA(+). Altered p53 electrophoretic mobility was found in 72% of cases and significantly more frequent in the presence of cagA. Considerable reduction in p27 expression (19%) was found with a tendency for association between cagA(+) and p27(-), although the results were not statistically significant. Concomitant alterations of both suppressor genes were detected in 60% of cases. In the cases cagA(+), 66.7% of them had these concomitant alterations. Conclusions: The data suggest that H. pylori cagA(+) contributes to p53 alteration and indicate that concomitant gene inactivation, with reduced p27 expression, may be a mechanism in which H. pylori can promote the development and progression of gastric cancer. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Genes in glucose metabolism and association with spina bifida.

The authors test single nucleotide polymorphisms (SNPs) in coding sequences of 12 candidate genes involved in glucose metabolism and obesity for associations with spina bifida. Genotyping was performed on 507 children with spina bifida and their parents plus anonymous control DNAs from Hispanic and Caucasian individuals. The transmission disequilibrium test was performed to test for genetic associations between transmission of alleles and spina bifida in the offspring (P < .05). A statistically significant association between Lys481 of HK1 (G allele), Arg109Lys of LEPR (G allele), and Pro196 of GLUT1 (A allele) was found ( P = .019, .039, and .040, respectively). Three SNPs on 3 genes involved with glucose metabolism and obesity may be associated with increased susceptibility to spina bifida.

The p53 tumor suppressor pathway in culture and {\it in vivo\/}

p53 functions as a tumor suppressor through its ability to initiate either growth arrest or apoptosis in cells which have sustained DNA damage. p53 elicits these cellular phenotypes through its biochemical function as a transcriptional activator. By inducing the expression of a battery of target genes, p53 is able to prevent the propagation of cells with damaged DNA. However, the genes transcriptionally induced by p53 which have been identified to date do not fully explain p53 function. p53 has been demonstrated to activate genes involved in cell cycle inhibition, apoptosis and cell proliferation. The reasons for simultaneous activation of p53 targets with disparate, opposing functions are not clear, but may be due to the use of transformed cell lines in previous experiments. In the studies presented in this thesis, the pathway of p53 tumor suppression has been studied in detail in two systems chosen for their relevance to the natural cell environment. One utilizes a normal, unaltered cultured cell system; the other the whole mouse. In order to better understand the role of the known p53 targets in effecting p53 function in normal cells, early rat embryo fibroblasts were irradiated with ultraviolet light to induce DNA damage. It was discovered that p53 protein levels increased in response to irradiation. The known targets of p53, namely, $p21\sp{WAF1/CIP1},\ mdm2,\ cyclin\ G,$ and bax, were shown for the first time to have a differential temporal induction. The growth suppressor $p21\sp{WAF1/CIP1}$ was induced first, followed by cyclin G then mdm2, which is involved in proliferation through its inactivation of p53, and finally, the apoptosis promoter, bax. These findings indicated that p53 activates its target genes in a manner to allow maximum effectiveness of target function. The rat embryo fibroblasts were shown to undergo apoptosis 24 h after irradiation. Additionally, investigation of these cells for cell cycle alterations demonstrated a brief arrest in G1. In the second study, thymocytes from mice with wild type p53 were shown to undergo apoptosis and activate p53 target genes upon ionizing radiation treatment, while thymocytes from mice deficient in p53 could not. The p53 target genes mdm2 and fas were tested in vivo for their ability to mediate p53-regulated apoptosis, and were found dispensible for that cellular function. Therefore, the p53 targets identified to date do not fully explain the ability of p53 to function as a tumor suppressor. Potentially, functional redundancy between the known targets would account for the data seen in these experiments. Additionally, identification of additional target genes should add further understanding of the p53 pathway of tumor suppression. ^